1990 - début du projet génome humain

1999 - séquençage du premier chromosome

conséquences aux variations du génome :

• aucune
• différence de phénotype
• faveur de risque pour l'apparition d'une maladie.

qualitatives :

variation moléculaire ou ponctuelle (< 1kb)

mutations simples :

• synonymes : pas de changement de nt au final
• non synonymes : changement de nt qui après la traduction entraîne un changement de AA par un autre.

les non-synonymes peuvent être :

• non-sens : le changement de nt entraîne un codon stop dans l'ADN = arrêt de traduction
• faux-sens : (+ fréquent) : le changement de nt fait qu'un AA dans l'ADN est remplacé par un autre.

les faux-sens peuvent être :

• non-conservatives : un AA est remplacé par un autre AA différent (hydrophile au lieu d'hydrophobe).
• conservatives : 2 AA semblables s'échangent.

indels : les + fréquentes font ~ 3 à 10 nt qui peuvent être transmises si elles touchent les cellules germinales.

variations submicroscopiques (entre 1kb et 3Mb)

CNV (12% du génome) : variations quantitatives, un endroit de l'ADN est dupliqué ou délété. en général elles font <10kb. On observe 75% de délétion.

variations microscopiques

anomalies des chromosomes :

on peut les étudier via le caryotypes

on peut voir des anomalies de max 3Mb

on peut voit des délétions, réarrangements, trisomies, monosomies...

évolution des gènes :

--> par duplication

• gène du collagène (COL1A1)
• gène de l'opsine
• gène de l'amylase

--> par brassage d'exons

les gènes sont des mosaïques d'exons et d'introns. Certains gènes peuvent échanger des exons.

--> par inactivation

• gène de la myosine 16 (MYH16) il y a 30 000 ans .

comparaison du génome

--> entre 2 gènes

degré d'homologie de la comparaison des séquences protéiques :

>25% = forte homologie (ex : myoglobine et hémoglobine)

entre 15 et 25% = homologie probable

< 15% = peu ou nulle

il y a 80% d'orthologues entre l'Homme et la souris.

--> entre les espèces

il existe une 100aine de séquences de bases en commun.

ce sont les UCE : des séquences courtes retrouvées chez l'Homme, les souris, les vaches ...

Elles sont maintenues dans les introns des régions régulatrices des gènes du développement, comme les gènes HOX. (HOX muté = embryon non viable)

--> entre l'Homme et le chimpanzé

il y a 99% d'homogénéité.

MYTH16 : inactivé progressivement mais encore présent chez le gorille.

HARF1 : séquences qui accélèrent la mutagénèse, le gène évoluera plus vite. Parmi eux des ARN qui régulent la différenciation des neurones = aidé l'Homme à acquérir 16 milliards de neurones.

FOXP2 : facteur de transcription qui favorise le guidage de connexions neuronales entre le centre du langage dans le lobe T et les muscles des cordes vocales = explique nos capacités d'articulations du langage importantes.

ASPM : provoque des microcéphalies, contrôle la forme de la cellule au moment de la mitose dans les pro géniteurs des neurones.

un neurone se différencie = 6 couches de neurones dans le cortex chez nous.

il a subit 45 substitutions dont la dernière date de 6 000 ans = l'écriture.