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Sciences: biologie : La synthèse des protéines

Définition

Protéine
Les protéines sont de longues chaînes d'acides aminés qui jouent un rôle crucial dans les fonctions cellulaires.
Acide aminé
Un acide aminé est une molécule organique qui constitue l'unité fondamentale des protéines.
ARNm (Acide RiboNucléique messager)
L'ARN messager est une copie d'un segment d'ADN qui est utilisé comme matrice pour la synthèse des protéines.
Ribosome
Les ribosomes sont des complexes moléculaires où la traduction de l'ARNm en protéines a lieu.
Codon
Un codon est une séquence de trois nucléotides dans l'ARNm qui correspond à un acide aminé spécifique.
Transcription
La transcription est le processus de copie d'une séquence d'ADN en ARN messager.
Traduction
La traduction est le processus par lequel l'information génétique portée par un ARNm est utilisée pour assembler une chaîne de polypeptides (protéines) dans les ribosomes.

La transcription de l'ADN

La première étape de la synthèse des protéines est la transcription, qui se déroule dans le noyau des cellules eucaryotes. Au cours de la transcription, l'enzyme ARN polymérase se lie à une région spécifique de l'ADN appelée promoteur. Elle en déroule ensuite la double hélice et synthétise un brin d'ARNm complémentaire à un segment d'ADN utilisé comme matrice. Une fois formé, l'ARNm précurseur (ou pré-ARNm) subit un processus de maturation, incluant l'ajout d'une coiffe en 5', l'ajout d'une queue poly-A en 3' et l'épissage, où les introns sont retirés et les exons sont reliés pour former l'ARNm mature. Cet ARNm mature est ensuite transporté hors du noyau vers le cytoplasme pour la traduction.

La traduction de l'ARNm

La traduction débute lorsque l'ARNm atteint le ribosome, qui peut être considéré comme l'usine de fabrication des protéines. La traduction se déroule en trois phases : initiation, élongation et terminaison. Lors de l'initiation, le petit sous-unité du ribosome se lie à l'extrémité 5' de l'ARNm et se déplace en direction de l'extrémité 3' jusqu'à ce qu'il rencontre le codon de départ (souvent AUG), lequel correspond à l'acide aminé méthionine. L'élongation se produit ensuite lorsque des acides aminés correspondant aux codons sur l'ARNm sont ajoutés un par un et liés entre eux par des liaisons peptidiques pour former une chaîne polypeptidique. Cela continue jusqu'à ce qu'un codon stop (comme UAA, UAG ou UGA) soit atteint, signalant au ribosome de libérer la chaîne polypeptidique nouvellement synthétisée dans le cytoplasme.

Post-traduction et repliement des protéines

Après la traduction, les protéines doivent souvent subir des modifications post-traductionnelles pour être pleinement fonctionnelles. Ces modifications peuvent inclure la phosphorylisation, la glycosylation, et la clivage protéolytique qui changent la conformation de la protéine ou lui attachent d'autres molécules. Le repliement correct des protéines est essentiel car il détermine leur fonction. Les chaperonnes moléculaires aident souvent les protéines à atteindre leur structure tridimensionnelle correcte.

A retenir :

La synthèse des protéines est un processus complexe en deux grandes étapes : la transcription et la traduction. Dans la transcription, une copie d'ARNm est créée à partir de l'ADN. Ensuite, lors de la traduction, cet ARNm est guidé par le ribosome pour assembler des acides aminés dans une chaîne polypeptidique qui se replie pour former une protéine active. Des modifications post-traductionnelles optimisent la fonction des protéines dans la cellule.

1. De l'ADN à l'ARN messager : la transcription

a. Un brin d'ADN sert de matrice

La transcription se déroule dans le noyau. Elle consiste en la copie d'une information codée contenue dans la molécule d'ADN en information codée contenue dans une molécule d'ARN messager.

b. Une opération catalysée par l'ARN-polymérase

La transcription commence par l'ouverture et le déroulement d'une portion de la molécule en double hélice d'ADN. Au fur et à mesure de sa progression le long de l'ADN, le complexe enzymatique que constitue l'ARN-polymérase incorpore des nucléotides présents dans le milieu cellulaire. Cette incorporation s'effectue par complémentarité des bases azotées avec l'un des brins de la molécule d'ADN : l'adénine (A) se place en face de la thymine (T) et l'uracile (U) se place en face de l'adénine (A), la cytosine(C) se place en face de la guanine (G) et inversement.

Le brin d'ARN messager ainsi synthétisé est complémentaire du brin d'ADN transcrit. L'information contenue dans l'ARN messager est identique à celle du brin d'ADN non transcrit. Le nucléotide uracile (U) occupe dans l'ARN la place du nucléotide thymine (T) de l'ADN.

L'ARN-polymérase se déplace toujours dans le même sens sur un brin et dans le sens opposé sur l'autre brin. Elle se détache sur un site présentant des caractéristiques particulières signalant la fin du gène. Ensuite, lorsque l'ARN-polymérase s'est détachée, les deux brins d'ADN s'associent de nouveau au fur et à mesure de l'avancé de l'enzyme, et se retrouvent comme ils étaient avant la synthèse d'ARN.

c. Un processus d'amplification

De l'ARN est produit très rapidement et en grande quantité : plusieurs molécules d'ARN-polymérase effectuent simultanément la transcription du même gène.

Plusieurs gènes peuvent être transcrits simultanément dans le noyau d'une même cellule.

2. De l'ARN à la protéine : la traduction

L'ARN messager produit dans le noyau passe dans le cytoplasme pour y être traduit : c'est la synthèse des protéines.

Elle se déroule en trois étapes :

  •  Initiation : Le ribosome, petit organite cytoplasmique (« atelier d'assemblage des protéines ») commence la lecture du gène dont la séquence est copiée sur l'ARN messager. Il reconnaît un endroit de la molécule appelé codon initiateur. Chaque ribosome est formé de deux sous-unités : la petite sous-unité porte un site de lecture de l'ARN messager et la grosse sous-unité présente un site catalytique. Un ribosome se comporte par conséquent comme une enzyme caractérisée par un site actif. Il catalyse la polymérisation des acides aminés de la protéine qui est en train de se former.
  •  
  •  Élongation : Le déplacement relatif du ribosome et de l'ARN messager s'accompagne de l'allongement progressif de la chaîne polypeptidique ; à chaque triplet de nucléotides de l'ARN messager correspond un acide aminé précis qui s'incorpore à la chaîne polypeptidique en formation. La correspondance entre les triplets de nucléotides de l'ARN messager et les acides aminés s'effectue selon les principes du code génétique. La prise en charge de chacun des 20 acides aminés s'effectue grâce à des ARNt (ARN transfert) spécifiques dont une partie se fixe sur chaque codon. Une liaison peptidique permet l'accrochage de chaque nouvel acide aminé (apporté par un ARN transfert) au dernier acide aminé de la chaîne en cours d'élongation. Le nouvel acide aminé arrivant devient provisoirement à son tour le dernier.
  •  
  •  Terminaison : Le ribosome parvient sur un des trois codons « stop » ou « non sens », codon auquel ne correspond aucun acide aminé. La dissociation entre l'ARN messager et la chaîne polypeptidique terminée s'effectue alors.



Sciences: biologie : La synthèse des protéines

Définition

Protéine
Les protéines sont de longues chaînes d'acides aminés qui jouent un rôle crucial dans les fonctions cellulaires.
Acide aminé
Un acide aminé est une molécule organique qui constitue l'unité fondamentale des protéines.
ARNm (Acide RiboNucléique messager)
L'ARN messager est une copie d'un segment d'ADN qui est utilisé comme matrice pour la synthèse des protéines.
Ribosome
Les ribosomes sont des complexes moléculaires où la traduction de l'ARNm en protéines a lieu.
Codon
Un codon est une séquence de trois nucléotides dans l'ARNm qui correspond à un acide aminé spécifique.
Transcription
La transcription est le processus de copie d'une séquence d'ADN en ARN messager.
Traduction
La traduction est le processus par lequel l'information génétique portée par un ARNm est utilisée pour assembler une chaîne de polypeptides (protéines) dans les ribosomes.

La transcription de l'ADN

La première étape de la synthèse des protéines est la transcription, qui se déroule dans le noyau des cellules eucaryotes. Au cours de la transcription, l'enzyme ARN polymérase se lie à une région spécifique de l'ADN appelée promoteur. Elle en déroule ensuite la double hélice et synthétise un brin d'ARNm complémentaire à un segment d'ADN utilisé comme matrice. Une fois formé, l'ARNm précurseur (ou pré-ARNm) subit un processus de maturation, incluant l'ajout d'une coiffe en 5', l'ajout d'une queue poly-A en 3' et l'épissage, où les introns sont retirés et les exons sont reliés pour former l'ARNm mature. Cet ARNm mature est ensuite transporté hors du noyau vers le cytoplasme pour la traduction.

La traduction de l'ARNm

La traduction débute lorsque l'ARNm atteint le ribosome, qui peut être considéré comme l'usine de fabrication des protéines. La traduction se déroule en trois phases : initiation, élongation et terminaison. Lors de l'initiation, le petit sous-unité du ribosome se lie à l'extrémité 5' de l'ARNm et se déplace en direction de l'extrémité 3' jusqu'à ce qu'il rencontre le codon de départ (souvent AUG), lequel correspond à l'acide aminé méthionine. L'élongation se produit ensuite lorsque des acides aminés correspondant aux codons sur l'ARNm sont ajoutés un par un et liés entre eux par des liaisons peptidiques pour former une chaîne polypeptidique. Cela continue jusqu'à ce qu'un codon stop (comme UAA, UAG ou UGA) soit atteint, signalant au ribosome de libérer la chaîne polypeptidique nouvellement synthétisée dans le cytoplasme.

Post-traduction et repliement des protéines

Après la traduction, les protéines doivent souvent subir des modifications post-traductionnelles pour être pleinement fonctionnelles. Ces modifications peuvent inclure la phosphorylisation, la glycosylation, et la clivage protéolytique qui changent la conformation de la protéine ou lui attachent d'autres molécules. Le repliement correct des protéines est essentiel car il détermine leur fonction. Les chaperonnes moléculaires aident souvent les protéines à atteindre leur structure tridimensionnelle correcte.

A retenir :

La synthèse des protéines est un processus complexe en deux grandes étapes : la transcription et la traduction. Dans la transcription, une copie d'ARNm est créée à partir de l'ADN. Ensuite, lors de la traduction, cet ARNm est guidé par le ribosome pour assembler des acides aminés dans une chaîne polypeptidique qui se replie pour former une protéine active. Des modifications post-traductionnelles optimisent la fonction des protéines dans la cellule.

1. De l'ADN à l'ARN messager : la transcription

a. Un brin d'ADN sert de matrice

La transcription se déroule dans le noyau. Elle consiste en la copie d'une information codée contenue dans la molécule d'ADN en information codée contenue dans une molécule d'ARN messager.

b. Une opération catalysée par l'ARN-polymérase

La transcription commence par l'ouverture et le déroulement d'une portion de la molécule en double hélice d'ADN. Au fur et à mesure de sa progression le long de l'ADN, le complexe enzymatique que constitue l'ARN-polymérase incorpore des nucléotides présents dans le milieu cellulaire. Cette incorporation s'effectue par complémentarité des bases azotées avec l'un des brins de la molécule d'ADN : l'adénine (A) se place en face de la thymine (T) et l'uracile (U) se place en face de l'adénine (A), la cytosine(C) se place en face de la guanine (G) et inversement.

Le brin d'ARN messager ainsi synthétisé est complémentaire du brin d'ADN transcrit. L'information contenue dans l'ARN messager est identique à celle du brin d'ADN non transcrit. Le nucléotide uracile (U) occupe dans l'ARN la place du nucléotide thymine (T) de l'ADN.

L'ARN-polymérase se déplace toujours dans le même sens sur un brin et dans le sens opposé sur l'autre brin. Elle se détache sur un site présentant des caractéristiques particulières signalant la fin du gène. Ensuite, lorsque l'ARN-polymérase s'est détachée, les deux brins d'ADN s'associent de nouveau au fur et à mesure de l'avancé de l'enzyme, et se retrouvent comme ils étaient avant la synthèse d'ARN.

c. Un processus d'amplification

De l'ARN est produit très rapidement et en grande quantité : plusieurs molécules d'ARN-polymérase effectuent simultanément la transcription du même gène.

Plusieurs gènes peuvent être transcrits simultanément dans le noyau d'une même cellule.

2. De l'ARN à la protéine : la traduction

L'ARN messager produit dans le noyau passe dans le cytoplasme pour y être traduit : c'est la synthèse des protéines.

Elle se déroule en trois étapes :

  •  Initiation : Le ribosome, petit organite cytoplasmique (« atelier d'assemblage des protéines ») commence la lecture du gène dont la séquence est copiée sur l'ARN messager. Il reconnaît un endroit de la molécule appelé codon initiateur. Chaque ribosome est formé de deux sous-unités : la petite sous-unité porte un site de lecture de l'ARN messager et la grosse sous-unité présente un site catalytique. Un ribosome se comporte par conséquent comme une enzyme caractérisée par un site actif. Il catalyse la polymérisation des acides aminés de la protéine qui est en train de se former.
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  •  Élongation : Le déplacement relatif du ribosome et de l'ARN messager s'accompagne de l'allongement progressif de la chaîne polypeptidique ; à chaque triplet de nucléotides de l'ARN messager correspond un acide aminé précis qui s'incorpore à la chaîne polypeptidique en formation. La correspondance entre les triplets de nucléotides de l'ARN messager et les acides aminés s'effectue selon les principes du code génétique. La prise en charge de chacun des 20 acides aminés s'effectue grâce à des ARNt (ARN transfert) spécifiques dont une partie se fixe sur chaque codon. Une liaison peptidique permet l'accrochage de chaque nouvel acide aminé (apporté par un ARN transfert) au dernier acide aminé de la chaîne en cours d'élongation. Le nouvel acide aminé arrivant devient provisoirement à son tour le dernier.
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  •  Terminaison : Le ribosome parvient sur un des trois codons « stop » ou « non sens », codon auquel ne correspond aucun acide aminé. La dissociation entre l'ARN messager et la chaîne polypeptidique terminée s'effectue alors.


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