🧠 1. Qu’est-ce que la phylogénie ?

La phylogénie est la science qui étudie les relations de parenté entre les espèces. Elle cherche à comprendre comment les espèces ont évolué à partir d’un ancêtre commun (notion de descendance avec modification).

Elle permet de construire un arbre évolutif (appelé arbre phylogénétique), où :

• chaque nœud représente un ancêtre commun hypothétique,
• chaque branche représente une lignée évolutive.

🧬 2. De la classification ancienne à la classification moderne

Pendant longtemps, les espèces ont été classées selon leur ressemblance apparente (forme, mode de vie), sans se baser sur leur origine évolutive.

🔹 Aristote (IVe siècle av. J.-C.)

• Classement selon le degré de perfection.
• Exemple : humains au sommet, puis les animaux, les plantes, etc.

🔹 Linné (XVIIIe siècle)

• A créé la classification binomiale (nom de genre + nom d’espèce), toujours utilisée aujourd’hui.
• Ex : Homo sapiens
• Il a introduit des catégories hiérarchiques : règne, embranchement, classe, ordre, famille, genre, espèce.
• Mais il classait surtout selon les similitudes morphologiques, pas selon les liens évolutifs.

🧱 3. Les limites des anciennes classifications

Ces classifications anciennes :

• mélangent des groupes sans lien évolutif réel (par exemple, les animaux qui volent comme les oiseaux et les chauves-souris),
• ignorent les groupes monophylétiques (c’est-à-dire tous les descendants d’un ancêtre commun),
• et ne reflètent pas la complexité réelle de l’évolution.

🌿 4. L’apport de la théorie de l’évolution

🔹 Lamarck (1809)

• Propose la première théorie de l’évolution : les espèces se transforment au cours du temps.
• Ex : le cou de la girafe s’allonge parce qu’elle l’utilise beaucoup.
• → Hypothèse du transformisme par usage et désuétude, aujourd’hui abandonnée.

🔹 Darwin (1859)

• Publie De l’origine des espèces
• Propose le concept de descendance avec modification, par sélection naturelle :
• Les individus les plus adaptés ont plus de chances de survivre et de transmettre leurs caractères.
• L’évolution se fait petit à petit, génération après génération.

🧬 5. Classification phylogénétique moderne (cladistique)

Introduite par Willi Hennig (1950), cette méthode repose sur :

• l’analyse des caractères dérivés partagés (appelés synapomorphies) pour établir les liens de parenté,
• la recherche des groupes monophylétiques (clades),
• une logique d’ancêtre commun exclusif, et non de simple ressemblance.

🔎 Vocabulaire clé :

Clade (ou groupe monophylétique): Regroupe un ancêtre commun et tous ses descendants

Synapomorphie : Caractère hérité d’un ancêtre commun, partagé par tous les membres du groupe (ex : vertèbres chez les vertébrés)

Nœud : Point de séparation dans l’arbre, correspondant à un ancêtre commun

Branche : Ligne qui relie deux nœuds ou un nœud à une espèce actuelle

📌 6. L’arbre du vivant

Les espèces actuelles sont toutes issues de l’évolution depuis un ancêtre commun universel (le LUCA = Last Universal Common Ancestor).

Aujourd’hui, on distingue trois grands domaines du vivant :

1. Bactéries (procaryotes)
2. Archées (procaryotes proches des eucaryotes)
3. Eucaryotes (animaux, plantes, champignons…)

🧠 Ce qu’il faut retenir :

• La phylogénie classe les espèces selon leurs liens de parenté évolutifs, pas juste leur ressemblance.
• La classification moderne est scientifique, rigoureuse, et repose sur les caractères partagés hérités d’un ancêtre commun (synapomorphies).
• L’arbre phylogénétique est un outil central pour représenter l’histoire du vivant.
• Cette approche a remplacé les classements anciens fixistes ou morphologiques, en introduisant une vision dynamique et évolutive du vivant.