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Lycée
Terminale

La complexification des génomes.

Définition

Transfert vertical
Lors de la reproduction, l'information génétique est transmise de génération en génération.
Transfert horizontal
Processus qui permet à un organisme d'intégrer du matériel génétique provenant d'un autre organisme contemporain sans en être apparenté. Le transfert horizontal est un mécanisme très fréquent entre différentes bactéries d'espèces différentes, mais cela existe aussi entre eucaryotes unicellulaires et entre les virus et tous les organismes vivants.
Symbiose
Association durable de deux organismes d'espèces différentes tirant bénéfice l'un de l'autre.
Endosymbiose
Symbiose particulière où l'un vit à l'intérieur des cellules ou des tissus de l'autre. L'organisme interne est appelé endosymbiote. Cette association est fréquente dans l'histoire évolutive des eucaryotes. Dans la plupart des cas, l'endosymbiose apporte à son hôte des avantages d'ordre nutritionnels. Il permet ainsi à l'hôte d'acquérir de nouveaux métabolismes. L'hôte procure à l'endosymbiote un milieu stable et protégé et parfois certains nutriments.

Complexification par échanges de gènes entre cellules : les transferts horizontaux.

A- Mise en évidence d'un transfert horizontal de gènes.


Cf expérience de Griffith.


Griffith montra qu'il existe un principe transformant pouvant passer d'une population de bactéries virulente à une autre non virulente et qui à son tour devient virulente. L'étape suivante consistait à identifier le support moléculaire responsable de cette transformation.


Cf expériences de Avery, McLeod et McCarty.


Ils ont montré parmi différentes molécules, que seul l'ADN était responsable de cette propriété transformante. L'autre enseignement est que les bactéries sont capables de s'échanger de l'ADN avec leur milieu.


B- Mécanismes de transferts horizontaux de gènes.


1- Les transferts horizontaux reposent sur l'universalité de la molécule d'ADN.


L'ADN est le support de l'information génétique. Elle présente la même structure et le même codage de l'information chez tous les êtres vivants. Grâce à l'universalité de l'ADN et à l'unicité de sa structure dans le monde vivant, des échanges génétiques peuvent se produire entre organismes non nécessairement apparentés (transgenèses).


2- Divers mécanismes de transferts horizontaux.


Les gènes assimilés par les organismes leur confèrent de nouveaux phénotypes. Chez les bactéries d'espèces différentes, on peut distinguer trois mécanismes principaux :

  • La transformation bactérienne : De l'ADN est en permanence libéré dans l'environnement à la suite de destruction de cellules. Dans certaines conditions, de l'ADN libre peut être intégré par les cellules avec lequel il entre en contact. Il s'agit d'un transfert passif d'ADN d'une bactérie donatrice morte à une bactérie réceptrice. Le transfert est partiel.









  • La conjugaison bactérienne : En plus de leur chromosome, les bactéries possèdent de petites molécules d'ADN circulaire, les plasmides. Ils sont transmissibles d'une bactérie à une autre. Un pont cytoplasmique se crée entre les deux bactéries tandis qu'un plasmide a été répliqué. La copie du plasmide passe par le pont. Il s'agit du principal facteur d'évolution des bactéries.
  • La transduction : Transfert d'ADN bactérien partiel en utilisant comme vecteur un virus bactérien qu'on appelle bactériophage. Il se fixe à une bactérie et amorce son cycle de reproduction en injectant son ADN dans la cellule. Cet ADN peut être intégré et rester dans le génome de la cellule hôte. A l'inverse, un peu de l'ADN de la cellule hôte peut être incorporé à l'ADN viral et être alors transporté jusqu'à de nouvelles cellules.


C- Impact en termes de santé humaine.


1- Antibiorésistance.


Les transferts horizontaux de gènes sont très fréquents entre bactéries. Des bactéries pathogènes de plus en plus nombreuses acquièrent des propriétés de résistance aux antibiotiques.


Exemple du staphylocoque doré : Le staphylocoque doré est responsable des maladies nosocomiales. Lorsque la barrière cutanée est rompue, une bactérie cutanée peut alors se développer au niveau de la lésion et provoquer une infection dont le degré de gravité dépendra de la souche bactérienne à l'origine de l'infection ainsi que la rapidité de traitement et l'état de santé général du patient.


Certaines de ces bactéries ont acquis une résistance à de multiples antibiotiques. Cette résistance est notamment acquise à cause du phénomène de conjugaison.


Certaines bactéries sont naturellement porteuses d'un gène leur conférent une résistance à un antibiotique. Alors, certaines bactéries ont acquis par transfert une multi-résistance aux antibiotiques.


2- Production de molécules thérapeutiques.


Notre connaissance de ces transferts nous permet de mieux maîtriser la production de médicaments. On parle de gènes d'intérêts qui sont transférés dans des cultures de bactéries ou de levures. Ces organismes produisent alors des molécules ayant un intérêt pharmaceutique.


D- L'importance des transferts génétiques horizontaux dans l'histoire de la Vie.


La comparaison de séquences d'ADN d'espèces différentes permet de construire des arbres phylogénétiques : en effet des similitudes génétiques traduisent généralement un héritage commun plus ou moins récent.

Mais il arrive qu'il y ait une similitude étonnante pour un gène particulier entre des espèces éloignées : c'est un transfert horizontal.

Ces transferts ont des effets importants sur l'évolution des populations et des écosystèmes (enrichir le génome + avantage évolutif).


Les espèces vivant dans un même écosystème échangent non seulement des nutriments et des signaux chimiques, mais également de l'ADN. Ce processus de transfert horizontal joue un rôle fondamental dans la diversification et l'enrichissement du patrimoine génétique des espèces.

Complexification par fusion entre organismes : les endosymbioses.









A- Endosymbiose : association étroite entre êtres vivants.


Les lichens sont des organismes formés par l'endosymbiose d'algues unicellulaires et de cellules de champignons appelées hyphes.

Les deux organismes associés fabriquent des molécules en commun que aucun des deux ne pourraient fabriquer seuls pour former la structure de l'organisme. Cette symbiose est basée sur la complémentarité des métabolismes entre l'algue autotrophe et le champignon hétérotrophe. Le photobionte synthétise ses propres composés organiques par photosynthèse, dont il cède une partie au mycobionte sous forme de glucose. En contrepartie, le mycobionte assure le captage d'eau sous forme liquide ou gazeuse. Cette eau permet l'alimentation en sels minéraux, ainsi qu'en vitamines indispensables pour la croissance du photobionte.


B- L'origine endosymbiotique des organites.


La théorie de L.Margulis en 1960 (explication endosymbiotique de l'origine de certains organites de la cellule) est aujourd'hui admise et même étendue à d'autres organites. Ainsi les mitochondries et chloroplastes seraient d'anciennes bactéries ayant été incorporées par des cellules plus volumineuses. Ces cellules apportent les nutriments nécessaires aux micro-organismes incorporés et ces derniers donnent d'autres capacités à la cellule hôte, lui conférant une meilleure adaptation. Ces grosses cellules anaérobies auraient donc acquis de nouveaux métabolismes tels que la respiration ou la photosynthèse grâce à des bactéries.


L'origine endosymbiotique des mitochondries et des chloroplastes est appuyée par différents arguments :

  • La taille des mitochondries et des chloroplastes est comparable à celle des bactéries.
  • Les mitochondries et des chloroplastes possèdent en partie leur propre ADN. On dit que ce sont des organites semi-autonomes. Il ont aussi des outils moléculaires permettant la réplication de leurs ADN.


Du fait de la présence d'ADN dans ces organites du cytoplasme eucaryote, certains caractères peuvent être transmis par cet ADN d'une génération à l'autre : on parle d'hérédité cytoplasmique.


Même si on observe un appauvrissement génétique de ces organites, une partie du génome de l'endosymbiote a été transféré dans le noyau de la cellule hôte (transfert horizontal).


Les mécanismes non liés à la RS permettent donc eux aussi d'enrichir et diversifier les génomes de tous les êtres vivants.

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La complexification des génomes.

Définition

Transfert vertical
Lors de la reproduction, l'information génétique est transmise de génération en génération.
Transfert horizontal
Processus qui permet à un organisme d'intégrer du matériel génétique provenant d'un autre organisme contemporain sans en être apparenté. Le transfert horizontal est un mécanisme très fréquent entre différentes bactéries d'espèces différentes, mais cela existe aussi entre eucaryotes unicellulaires et entre les virus et tous les organismes vivants.
Symbiose
Association durable de deux organismes d'espèces différentes tirant bénéfice l'un de l'autre.
Endosymbiose
Symbiose particulière où l'un vit à l'intérieur des cellules ou des tissus de l'autre. L'organisme interne est appelé endosymbiote. Cette association est fréquente dans l'histoire évolutive des eucaryotes. Dans la plupart des cas, l'endosymbiose apporte à son hôte des avantages d'ordre nutritionnels. Il permet ainsi à l'hôte d'acquérir de nouveaux métabolismes. L'hôte procure à l'endosymbiote un milieu stable et protégé et parfois certains nutriments.

Complexification par échanges de gènes entre cellules : les transferts horizontaux.

A- Mise en évidence d'un transfert horizontal de gènes.


Cf expérience de Griffith.


Griffith montra qu'il existe un principe transformant pouvant passer d'une population de bactéries virulente à une autre non virulente et qui à son tour devient virulente. L'étape suivante consistait à identifier le support moléculaire responsable de cette transformation.


Cf expériences de Avery, McLeod et McCarty.


Ils ont montré parmi différentes molécules, que seul l'ADN était responsable de cette propriété transformante. L'autre enseignement est que les bactéries sont capables de s'échanger de l'ADN avec leur milieu.


B- Mécanismes de transferts horizontaux de gènes.


1- Les transferts horizontaux reposent sur l'universalité de la molécule d'ADN.


L'ADN est le support de l'information génétique. Elle présente la même structure et le même codage de l'information chez tous les êtres vivants. Grâce à l'universalité de l'ADN et à l'unicité de sa structure dans le monde vivant, des échanges génétiques peuvent se produire entre organismes non nécessairement apparentés (transgenèses).


2- Divers mécanismes de transferts horizontaux.


Les gènes assimilés par les organismes leur confèrent de nouveaux phénotypes. Chez les bactéries d'espèces différentes, on peut distinguer trois mécanismes principaux :

  • La transformation bactérienne : De l'ADN est en permanence libéré dans l'environnement à la suite de destruction de cellules. Dans certaines conditions, de l'ADN libre peut être intégré par les cellules avec lequel il entre en contact. Il s'agit d'un transfert passif d'ADN d'une bactérie donatrice morte à une bactérie réceptrice. Le transfert est partiel.









  • La conjugaison bactérienne : En plus de leur chromosome, les bactéries possèdent de petites molécules d'ADN circulaire, les plasmides. Ils sont transmissibles d'une bactérie à une autre. Un pont cytoplasmique se crée entre les deux bactéries tandis qu'un plasmide a été répliqué. La copie du plasmide passe par le pont. Il s'agit du principal facteur d'évolution des bactéries.
  • La transduction : Transfert d'ADN bactérien partiel en utilisant comme vecteur un virus bactérien qu'on appelle bactériophage. Il se fixe à une bactérie et amorce son cycle de reproduction en injectant son ADN dans la cellule. Cet ADN peut être intégré et rester dans le génome de la cellule hôte. A l'inverse, un peu de l'ADN de la cellule hôte peut être incorporé à l'ADN viral et être alors transporté jusqu'à de nouvelles cellules.


C- Impact en termes de santé humaine.


1- Antibiorésistance.


Les transferts horizontaux de gènes sont très fréquents entre bactéries. Des bactéries pathogènes de plus en plus nombreuses acquièrent des propriétés de résistance aux antibiotiques.


Exemple du staphylocoque doré : Le staphylocoque doré est responsable des maladies nosocomiales. Lorsque la barrière cutanée est rompue, une bactérie cutanée peut alors se développer au niveau de la lésion et provoquer une infection dont le degré de gravité dépendra de la souche bactérienne à l'origine de l'infection ainsi que la rapidité de traitement et l'état de santé général du patient.


Certaines de ces bactéries ont acquis une résistance à de multiples antibiotiques. Cette résistance est notamment acquise à cause du phénomène de conjugaison.


Certaines bactéries sont naturellement porteuses d'un gène leur conférent une résistance à un antibiotique. Alors, certaines bactéries ont acquis par transfert une multi-résistance aux antibiotiques.


2- Production de molécules thérapeutiques.


Notre connaissance de ces transferts nous permet de mieux maîtriser la production de médicaments. On parle de gènes d'intérêts qui sont transférés dans des cultures de bactéries ou de levures. Ces organismes produisent alors des molécules ayant un intérêt pharmaceutique.


D- L'importance des transferts génétiques horizontaux dans l'histoire de la Vie.


La comparaison de séquences d'ADN d'espèces différentes permet de construire des arbres phylogénétiques : en effet des similitudes génétiques traduisent généralement un héritage commun plus ou moins récent.

Mais il arrive qu'il y ait une similitude étonnante pour un gène particulier entre des espèces éloignées : c'est un transfert horizontal.

Ces transferts ont des effets importants sur l'évolution des populations et des écosystèmes (enrichir le génome + avantage évolutif).


Les espèces vivant dans un même écosystème échangent non seulement des nutriments et des signaux chimiques, mais également de l'ADN. Ce processus de transfert horizontal joue un rôle fondamental dans la diversification et l'enrichissement du patrimoine génétique des espèces.

Complexification par fusion entre organismes : les endosymbioses.









A- Endosymbiose : association étroite entre êtres vivants.


Les lichens sont des organismes formés par l'endosymbiose d'algues unicellulaires et de cellules de champignons appelées hyphes.

Les deux organismes associés fabriquent des molécules en commun que aucun des deux ne pourraient fabriquer seuls pour former la structure de l'organisme. Cette symbiose est basée sur la complémentarité des métabolismes entre l'algue autotrophe et le champignon hétérotrophe. Le photobionte synthétise ses propres composés organiques par photosynthèse, dont il cède une partie au mycobionte sous forme de glucose. En contrepartie, le mycobionte assure le captage d'eau sous forme liquide ou gazeuse. Cette eau permet l'alimentation en sels minéraux, ainsi qu'en vitamines indispensables pour la croissance du photobionte.


B- L'origine endosymbiotique des organites.


La théorie de L.Margulis en 1960 (explication endosymbiotique de l'origine de certains organites de la cellule) est aujourd'hui admise et même étendue à d'autres organites. Ainsi les mitochondries et chloroplastes seraient d'anciennes bactéries ayant été incorporées par des cellules plus volumineuses. Ces cellules apportent les nutriments nécessaires aux micro-organismes incorporés et ces derniers donnent d'autres capacités à la cellule hôte, lui conférant une meilleure adaptation. Ces grosses cellules anaérobies auraient donc acquis de nouveaux métabolismes tels que la respiration ou la photosynthèse grâce à des bactéries.


L'origine endosymbiotique des mitochondries et des chloroplastes est appuyée par différents arguments :

  • La taille des mitochondries et des chloroplastes est comparable à celle des bactéries.
  • Les mitochondries et des chloroplastes possèdent en partie leur propre ADN. On dit que ce sont des organites semi-autonomes. Il ont aussi des outils moléculaires permettant la réplication de leurs ADN.


Du fait de la présence d'ADN dans ces organites du cytoplasme eucaryote, certains caractères peuvent être transmis par cet ADN d'une génération à l'autre : on parle d'hérédité cytoplasmique.


Même si on observe un appauvrissement génétique de ces organites, une partie du génome de l'endosymbiote a été transféré dans le noyau de la cellule hôte (transfert horizontal).


Les mécanismes non liés à la RS permettent donc eux aussi d'enrichir et diversifier les génomes de tous les êtres vivants.

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