Appareil génital femelle composé 2 ovaires, 2 oviductes, 2 utérus, 2 ou 3 vagins.
Vagins latéraux constants servent recevoir sperme, qui peut-être déposer soit dans un des deux soit dans deux vagins lorsque pénis mâle est bilobé.
Lors mise bas , fœtus passe par canal qui se forme dans tissus situés entre uretères, appelé vagins centrale, vagin médian, pseudo-vagin ou canal de naissance.
Chez plupart espèces, canal est transitoire et se forme uniquement avant chaque naissance. Chez Macropus, reste ouvert après première naissance, femelles ont donc 3 vagins permanant.
Comme chez mâle, voies génitales terminent avec uretères dans sinus urogénitale s'ouvrant dans cloaque.
Marsupium est caractéristique exclusive des marsupiaux.
Chez certaines espèces, s'agit pas vraie poche mais repli de peau, crée grâce contraction de muscle cutanés qui recouvrent temporairement mamelles et protèges petits.
Chez plupart espèces, s'agit vraie poche s'ouvrant vers l'avant mais parfois vers l'arrière ( Wombats et Koala). Chez Wombats, suppose cette orientation permet limiter quantité terre dans poche lors creusage terrier. Mais chez koala orientation inexpliqué..(peut-être liens ancestraux avec wombats), cependant peut permettre jeunes accéder au fèces mère dont ingestion faciliterait inoculation au niveau digestif, bactéries nécessaire pour suite bonne digestion feuilles.
Mamelles dissimulées dans poche, nbre varie entre 2 et 13 mais le plus souvent :
- 2 chez koala et wombats
- 4 chez kangourous, wallabies et diable de Tasmanie
Seules petites espèces ont grand nombre mamelles.