translocation

translocation des protéines luminales du RE :

--> extrémité N-term du côté cytosolique

--> protéine s'allonge dans son exodomaine

clivage du peptide signal par la signal peptidase

la protéine est synthétisée sur une longueur d'environ 150 AA = clivage co-traduc et co-translo

ouverture du translocon latéralement :

• peptide signal dégradé par des protéases membranaires
• protéine continue d'être traduite et libérée dans le lumen du RE

--> translocon change de conformation et est inactivé

--> protéine acquière sa topologie selon les membranes du système endomembranaire dans le RE :

• luminale dans tout le système endomembranaire
• sécrétée si elle est adressée à la membrane plasmique

3 types de protéines à une traversée :

• type I : SIT clivable / C-term cytosolique / N-term luminale
• type II : non clivable / C-term luminale / N-term cytosolique
• type III : non clivable / C-term cytosolique / N-term luminale

Type II :

• SIT en position interne, constitué d'une 20 aine d'AA hydrophobes, reconnu par la SRP
• le sens d'intégration de la protéine dans le translocon dépend de la charge des AA proches du SIT
• les AA préc