Environ deux millénaires séparent la formation des premières cultures néolithiques en Égypte et l'apparition de la constitution progressive d'un territoire unifié culturellement et politiquement.

On rassembles ces cultures du néolithiques sous la période de Nagada (site éponyme). Cette période est elle-même divisée en trois grandes époques, Nagada I, II et III.

Elle s'étend de -4000 avant JC jusqu'à -2700 avant JC.

À la fin de cette période prédynastique serait née la 1ère dynastie, dont il nous reste "la palette de Narmer". Cette palette, commandée par le 1er Roi de la 1ère dynastie, est plutôt une représentation de l'idéologie royale.

Revenons à la culture de Nagada, vers 3550 avant JC, on assiste à une unification culturelle et non pas politique. Des poteries sont retrouvées, suivant toutes le même code. Elles sont de couleur rouge avec des dessins blanc dessus.

Les thèmes représentés sont souvent des scènes de domination sur des ennemis ou sur des animaux sauvages jugés dangereux. Les chefs sont donc représentés avec des barbes et tenant une arme, une massue dans leur main, prête à être abattue sur l'ennemi.

Dans la même logique de hiérarchisation, les complexes funéraires commencent à marquer les différences sociales. Les "chefs" ont de plus grandes tombes, avec plus de mobilier funéraire pour certaines, etc. On y retrouve des animaux sauvages dangereux inhumés avec un chef dans le cimetière 6 de Hiérakonpolis.

La Haute-Égypte montre des signes claires de hiérarchisation, ce qui n'est pas le cas de la Basse-Égypte.

À partir de 3325 avant JC, l'Égypte s'unifie aussi politiquement, et on assiste à la naissance de la première monarchie. Elle émarge en différents points géographiques, comme à Abydos ou Hiérakonpolis.

Nous avons retrouvé une tombe datant cette période à Abydos (U-J) avec les premières traces d'écriture (signes hiéroglyphiques), pourvue de matériels funéraires (jarres de vin...).